mastodonでchewy:deployしているとたまにtimeout以外のエラーになることがあります。サーバ側のエラーを見てみると、このようなエラーが出ています。
/var/log/elasticsearch/elasticsearch.log
already closed by tragic event on the index writer
java.lang.StackOverflowError: null
文字通り、スタックオーバーフローです。これを回避するには、jvm.optionsに-Xssオプションを追加します。
メモリに余裕があるなら、「-Xss:128m」ぐらい指定しておけば大丈夫でしょう。